Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01797 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01797 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01797 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01797 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01797 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01797 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms