Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01740 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01740 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01740 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01740 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01740 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01740 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01740 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01740 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01740 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01740 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01740 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01740 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms