Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms