Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Casp8O89110 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Casp8O89110 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms