Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apaf1O88879 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apaf1O88879 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms