Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd160O88875 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms