Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F11rO88792 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
F11rO88792 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
F11rO88792 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
F11rO88792 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms