Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1O88746 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1O88746 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1O88746 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1O88746 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms