Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmx1bO88609 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmx1bO88609 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmx1bO88609 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmx1bO88609 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmx1bO88609 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmx1bO88609 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms