Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cops3O88543 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cops3O88543 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms