Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf5O70191 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf5O70191 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf5O70191 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atf5O70191 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms