Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3aO70157 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top3aO70157 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms