Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt5hO55201 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt5hO55201 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms