Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Syngr2O55101 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Syngr2O55101 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms