Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ptpn20O55082 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptpn20O55082 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ptpn20O55082 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ptpn20O55082 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ptpn20O55082 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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