Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnk2O54967 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnk2O54967 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnk2O54967 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnk2O54967 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnk2O54967 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnk2O54967 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnk2O54967 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms