Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NfkbieO54910 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfkbieO54910 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms