Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh16O54909 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms