Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Csnk2a2O54833 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk2a2O54833 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk2a2O54833 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms