Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Nek2O35942 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Nek2O35942 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nek2O35942 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek2O35942 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Nek2O35942 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nek2O35942 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Nek2O35942 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Nek2O35942 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Nek2O35942 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Nek2O35942 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nek2O35942 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nek2O35942 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms