Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Prrt1O35449 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrt1O35449 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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