Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kpna3O35344 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kpna3O35344 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms