Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f3O35261 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2f3O35261 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2f3O35261 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms