Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pkd2O35245 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms