Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smad6O35182 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms