Protein–RNA interactions for Protein: O35130

Emg1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emg1O35130 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emg1O35130 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Emg1O35130 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Emg1O35130 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms