Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gfra3O35118 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms