Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnk3O35111 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms