Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl1O09117 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sypl1O09117 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl1O09117 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl1O09117 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl1O09117 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sypl1O09117 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sypl1O09117 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms