Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema3aO08665 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms