Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm3488M0QW81 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3488M0QW81 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3488M0QW81 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm3488M0QW81 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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