Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
IfnabL7MTU6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IfnabL7MTU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms