Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gm21310J3QQ23 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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