Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm21972J3QN38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm21972J3QN38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm21972J3QN38 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21972J3QN38 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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