Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3727J3QM54 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm3727J3QM54 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3727J3QM54 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm3727J3QM54 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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