Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
7530416G11RikJ3QJX6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms