Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm21060J3KMU4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm21060J3KMU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
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