Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20828J3KMI7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms