Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm29394H3BIW7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms