Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SprtnG3X912 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SprtnG3X912 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms