Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r167G3UW71 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms