Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pira2F8VQ94 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pira2F8VQ94 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pira2F8VQ94 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms