Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Gm20538F6Z9R1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms