Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sptbn5F6UCX4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms