Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Svs3aF2Z472 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Svs3aF2Z472 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms