Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TrdnE9Q9K5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms