Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FancfE9Q5Z5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FancfE9Q5Z5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms