Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pde8bE9Q4S1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pde8bE9Q4S1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms