Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Susd1E9Q3H4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms