Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
5430401F13RikE9Q328 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
5430401F13RikE9Q328 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms